亞佛加厥曾經日以繼夜地，在他的實驗室裡做實驗，他拿了一罐氫氣和一罐氯氣，竟然產生了兩罐的氯化氫，然後他發現了一件事情，他在想，如果一罐氫氣裡有一顆氫原子，一罐氯氣裡有一顆氯原子，那變成的兩罐氯化氫，每一罐不就是半顆氫原子，跟半顆氯原子嗎？不對，半顆原子是不存在的。

於是亞佛加厥開始假設，會不會氫氣是兩顆氫原子黏在一起，氯氣是兩顆氯原子黏在一起，那這樣就剛好能生成兩份氯化氫，而且也不會切到原子。

這樣的假設也完美地解釋了另一個狀況，也就是水。科學家們早就知道，兩罐的氫氣和一罐的氧氣，會變成兩罐的水，如此一來，水就剛好會是兩個氫和一個氧的H2O。這種好幾顆原子黏在一起的狀態，亞佛加厥就稱之為「分子」。

各種氣體後來也被發現有各種分子，而這個分子的概念就這樣補足了原子說沒辦法解釋氣體反應的困境，也把氣體體積跟原子說的關係，做了巧妙地連結。