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受傷DNA修復的觀察

95/06/07 瀏覽次數 14329
看到細胞修復的過程

由於臭氧層的破壞日趨嚴重,人類受日光中紫外線照射的機率也隨著增加。紫外線會傷害細胞內的去氧核醣核酸(DNA),若不加以修護,可能導致基因突變或癌症的發生。幸好人類細胞有一套修復機制,可修復這種因紫外線照射所造成的DNA傷害。最近有一項漸受研究者採用的實驗技術-微孔紫外線照射(micropore UV irradiation),這項實驗技術配合一般免疫螢光染色法,便可以觀察修復機制在細胞中運作的情形。

微孔紫外線照射技術最初是由日本森俊雄(Toshio Mori)博士及其同仁於2001年提出的(J. Invest. Dermatol. 117 (2001)1156-1161),他們利用實驗室常用的濾膜(平時用來過濾分子或細菌)做為濾鏡,讓紫外線只能穿過3~5微米(μm)的孔洞,使得被照細胞的DNA只有局部受傷,再輔以傳統的免疫螢光染色,就可以觀察到不同時間及空間下活細胞DNA受傷後的修補過程。

細胞的自我修復機制

過度曝曬紫外線除了造成皮膚變黑與老化之外,也可能導致基因突變或細胞癌化。當細胞受到短波長紫外線照射後,會產生兩種主要的DNA傷害,即環丁嘧啶二聚體(簡稱CPD)和嘧啶6-4二聚體(簡稱6-4PP),這二者都是DNA分子鹼基(嘧啶)間異常的鍵結物。

細胞中有一套修復機制,即核酸切割修補(nucleotide excision repair,簡稱NER),能夠修復這些DNA傷害。NER是一種由一系列修復蛋白質所參與的機制,當DNA傷害產生後,修復蛋白便會前去辨識,再經由切除、填補、黏合等步驟完成修復。

幫助細胞修復

在人群中有些人帶著體隱性遺傳疾病,例如色素性乾皮症(Xeroderma Pigmentosum,簡稱XP),由於缺乏某種正常的NER基因,無法像正常人一樣修復這些DNA傷害,因此他們對光照非常敏感。這些XP病患除了有皮膚癌高罹患率的顧慮外,也容易有其他體內器官癌變的隱憂。過去學者在研究細胞中的DNA修復機制時,由於傷害範圍太大無法清楚觀察細胞的修復運作,現在因為有微孔紫外線照射技術,上述的困擾就得以解決。

我們可以藉由這種技術,僅允許部分紫外線從濾膜上的小孔洞穿過,把DNA傷害局限在核的某一小區域,以便觀察修復蛋白集合到傷害區域的情形。藉上述方法對細胞進行微孔紫外線照射之後,移除濾膜讓細胞修護一段時間,再利用可以辨識CPD或6-4PP的抗體,或者是修復蛋白的抗體進行免疫螢光染色,以便觀察DNA損壞與修復蛋白共位(co-localization)的情形。

免疫螢光染色法是先以專一性高的一級抗體來辨識標的物,再給予帶有螢光的二級抗體來辨識一級抗體,如此,經由觀察螢光顯微鏡所看到的螢光訊號,便可以找到標的物的位置。

DNA修復過程的實例

以人類纖維母細胞MSU-1為實驗材料,在薄膜覆蓋下進行微孔紫外線照射(波長254奈米,能量密度是100焦耳/平方公尺),30分鐘後,利用CPD抗體和修復蛋白XPB抗體進行螢光染色。XPB具有核酸解旋瓷活性,在NER過程中負責解開DNA雙股螺旋以利切除傷害的部位。

首先對某一視野的所有細胞核以DAPI染色,DAPI是一種有機小分子,可以插入雙股DNA的溝槽中形成DNA-DAPI複合物,由於它會吸收特定波長而釋放藍色螢光,因此可用來確定DNA的位置。接著在同一視野內以CPD抗體螢光染色,因其二級抗體帶有釋放紅色螢光的探針,所以訊號是紅色。當部分細胞核內含紅色顆粒狀螢光訊號時,就表示細胞核受到局部傷害。

在同一視野內再以XPB抗體螢光染色,因其二級抗體帶有釋放綠色螢光的探針,所以它的訊號是綠色,受傷部分的細胞核內會呈現顆粒狀綠色訊號。把利用CPD染色的照片與利用XPB染色的照片重疊,照片上的綠色訊號和紅色訊號恰好在同一位置,表示XPB和CPD的位置是一致的,因此可知MSU-1細胞經紫外線照射後,隔30分鐘就有修復蛋白XPB到DNA損害處進行修復。

以中國倉鼠卵巢細胞CHO-KI及帶有NER缺陷的同源細胞株UV24做為實驗材料,進行紫外線局部照射。這二種實驗材料經紫外線照射後,立刻用6-4PP抗體進行免疫螢光染色,可以看到細胞受到局部傷害的訊號。若讓細胞經過9小時的修復,便已無法在CHO-KI中偵測到6-4PP的訊號。然而以同樣方式處理UV24細胞,6-4PP的螢光訊號仍然存在,顯示CHO-KI在這段時間可以完全修復細胞的6-4PP傷害,UV24細胞則不能。

眼見為憑

我們常說「眼見為憑」,紫外線局部照射加上免疫螢光染色的研究技術,似乎可以替這句成語作註解。新技術協助我們對格物致知的真理追求,真正「看見」DNA損傷與修復的過程。

上述的兩個實驗只是當作例子說明,這項新技術的應用當然不只是如此。另一方面值得一提的是,NER除了修補因短波紫外線造成的DNA損傷外,也負責修補其他許多化學物質如吸菸、油煙、藥物所造成的DNA損傷,因此核酸切割修補的效率與我們健康息息相關,不單只是對付紫外線曝曬的問題而已。
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