生物完整性指標(Indices of Biological Integrity,IBI):是被廣泛用來作為河流中生物的監測評估方法,指標分為三大類,一為魚種豐富度與組成(species richness and composition);二為魚類營養階層組成(trophic composition);三為魚類數量與狀況(fish abundance and condition individuals),指標項目可依據需求及環境進行調整修改。而每個項目都有評分等級,計算方式是利用蒐集資料與參考值之間的差異性給予5=最佳、3=中等、1=最差的評分等級,進而分析出監測環境的生物環境品質為何。